Pozdější roky
Jako deklarovaný heretický a veřejný trestný čin byl Luther nucen zdržet se politického a náboženského boje za prosazení Ediktu červů. Sympatičtí vládci a městské rady se stali protagonisty Lutherovy věci a příčiny reforem. Když Charles V svolal dietu, aby se setkal v Augsburgu v roce 1530 k řešení nevyřešených náboženských otázek, sám Luther nemohl být přítomen, i když se mu podařilo cestovat až na jih jako Coburg - stále asi 100 mil severně od Augsburgu - sledovat vývoj na dietě. V Augsburgu to bylo na Lutherův mladý Wittenberg kolega Philipp Melanchthon reprezentovat protestanty. Melanchthonovo shrnutí víry reformátorů, Augsburgské vyznání, se rychle stalo hlavním teologickým dokumentem pro vznikající luteránskou tradici.
Lutherova role v reformaci po roce 1525 byla role teologa, poradce a facilitátora, ale nikoli role člověka činu. Biografie Luthera mají tedy tendenci ukončit svůj příběh jeho manželstvím v roce 1525. Takové účty statečně opomíjejí posledních 20 let svého života, během nichž se toho hodně stalo. Problém není jen v tom, že příčina nových protestantských církví, které Luther pomohl založit, byla v podstatě sledována bez jeho přímého zapojení, ale také to, že Luther z těchto pozdějších let se jeví méně atraktivní, méně šikovný, méně přitažlivý než dřívější Luther, který vzdorně čelil císaři a říši u Worms. Luther se opakovaně vtáhl do prudkých kontroverzí během posledního desetiletí svého života a objevuje se jako jiná postava - nerozumná, dogmatická a nejistá. Jeho tón se stal ostrým a pronikavým, ať už v komentářích k Anabaptistům, papeži nebo Židům. V každém případě byly jeho výroky virulentní: Anabaptisté by měli být pověšeni jako seditionisté, papež byl Antikrist, Židé měli být vyloučeni a jejich synagogy spáleny. Taková byla těžko irenická slova ministra evangelia a žádné z nabízených vysvětlení - jeho zhoršující se zdraví a chronická bolest, jeho očekávání nadcházejícího konce světa, jeho hluboké zklamání z neúspěchu skutečné náboženské reformy - vypadají uspokojivě.
V 1539 Luther byl zapleten do skandálu obklopovat bigamii Philipa, landgrave Hesse. Stejně jako mnoho jiných korunovaných hlav i Filip žil v dynasticky uspořádaném manželství s manželkou, pro kterou neměl náklonnost. Zapojení do mimomanželských vztahů však narušilo jeho svědomí, takže po celá léta se cítil nehodný přijímat přijímání. Jeho oči upadly na jednu z čekajících dámských žen, která trvala na manželství. Philip se obrátil na Luthera a Wittenbergovy teology o radu. Ve své odpovědi, kterou hojně rozšířil biblickými odkazy, Luther poznamenal, že patriarchové Starého zákona byli ženatí s více než jednou ženou a že jako zvláštní dispenzace byla polygamie stále možná. Filip proto tajně uzavřel druhé manželství, ale brzy se to stalo známým - stejně jako Lutherova role v jeho realizaci.
Od poloviny 30. let byl Luther sužován ledvinami a zjevným koronárním stavem. Trochu nesmyslně připisoval své špatné zdraví závažnosti svého života v klášteře. Přesto pokračoval ve svém akademickém učení - od roku 1535 do roku 1545 přednášel o knize Genesis, jedné z jeho nejvzhlednějších biblických expozic - a pravidelně kázal v městském kostele, dokud jeho odpovědnost převzal jeho kolega Johannes Bugenhagen. Ještě tehdy Luther kázal v augustiniánském klášteře. Po smrti jednoho z jeho nejstarších přátel, Nikolause Hausmanna, v roce 1538 a smrti jeho dcery Magdalény o čtyři roky později, se odkazy na smrt v Lutherově korespondenci staly stále hojnější. Tak napsal v červnu 1543 dopis příteli:
Přál bych si, aby mi byla dána dobrá hodina, až budu moci postupovat k Bohu. Měl jsem dost. Jsem unavený. Nic jsem se nestal. Modlete se za mě upřímně, aby Pán mohl klidně vzít mou duši.
V únoru 1546 Luther odcestoval navzdory svému špatnému zdraví do města Eisleben, kde se narodil. Vydal se za zprostředkování trapného hádky mezi dvěma mladými a arogantními šlechtici, hraběte Albrechtem a Gebhardem z Mansfeldu. Byl úspěšný a tak informoval svou ženu o tom, co se ukázalo být jeho posledním dopisem. O den později, 18. února, přišla smrt. Jeho tělo bylo pohřbeno v hradním kostele ve Wittenbergu.
