Martin H. Rathke, (narozený 25. srpna 1793, Danzig, Prusko [nyní Gdaňsk, Pol.] - zemřel 3. září 1860, Königsberg [nyní Kaliningrad, Rusko]), německý anatom, který poprvé popsal žabí štěrbiny a žaberní oblouky v embryích savců a ptáků. V roce 1839 také poprvé popsal embryonální strukturu, nyní známou jako Rathkeho váček, ze kterého se vyvíjí přední lalok hypofýzy.
Rathke ukončil desetiletou lékařskou praxi ve svém rodném městě, když se stal profesorem fyziologie na univerzitě v Dorpatu a později (1835) profesorem zoologie a anatomie v Königsbergu. Rathke byl vynikající embryolog a myslel si, že žaberní oblouky jsou pozůstatky předchůdců, ale také si uvědomil jejich význam v pozdějším vývoji souvisejících krevních cév. Rathke také udělal průkopnický výzkum v mořské zoologii. V roce 1855 byl zvolen za člena Královské společnosti.
