Osvobozovací boj v Tanganice vedl Africký národní svaz Tanganika, jehož vlajkou byla horizontální trikolóra zeleno-černá-zelená. Volby potvrdily ohromnou populární podporu organizace a britské úřady navrhly upravit vlajku strany pro použití jako národní vlajka po nezávislosti 9. prosince 1961. Tehdy byly přidány žluté fimbriace.
Pod arabskou vládou Zanzibar dlouho létal po červené vlajce, ale 12. ledna 1964 se k moci dostal černý africký režim pod vlajkou černé, žluté a modré. Následující měsíc vládnoucí afro-širazská strana zavedla novou státní vlajku podobnou té své. Horizontální modro-černé-zelené pruhy stály u moře, u lidí a u země, zatímco úzký bílý svislý pruh u výtahu byl pro mír.
V dubnu 1964 se země Tanganika a Zanzibar sjednotily a začátkem července se jejich vlajkové tradice roztavily a vytvořily novou národní vlajku Tanzanie. Barvy vlajky byly diagonálně včleněny kvůli rozlišovací způsobilosti. Většina obyvatel země je symbolizována černým pruhem, zatímco zelená naznačuje bohaté zemědělské zdroje země. Minerální bohatství se odráží v úzkých žlutých hranicích, zatímco Indický oceán je symbolizován modrou barvou. Poté, co se Zanzibar spojil s Tanganikou, byla na těchto ostrovech nadále používána lokální vlajka Zanzibaru.
