V různých uměleckých reprezentacích se centrální budova Angkor Wat objevila na khmerských státních vlajkách od 19. století, v počátcích francouzského protektorátu nad Kambodžou. První vlajka byla červená ohraničena modře s chrámem v bílém. Vlajka byla „modernizována“ v roce 1948 přijetím nerovných vodorovných pruhů tmavě modré, červené a tmavě modré a chrám byl změněn tak, aby přesněji odpovídal originálu. Tato vlajka pokračovala v používání i poté, co se Kambodža stala nezávislou. Konec monarchie a vyhlášení Khmerské republiky však vyústily v novou vlajku v říjnu 1970. „Základní vlajka“ se stala kantonem, zatímco pole bylo modré se třemi bílými hvězdami.
Komunističtí rebelové poprvé používali vlajku 1948–70, ale k moci se dostali v dubnu 1975 pod čistou červenou vlajkou. Když jejich Demokratická Kampuchea přijala svou ústavu v lednu 1976, byla ve středu červené vlajky umístěna trojitá věž se žlutým chrámem, která měla být nahrazena pěti věžemi se žlutým chrámem, když vietnamské síly prohlásily Kampuchea za lidovou republiku. v roce 1979. Rivalské vlády „Kambodžského státu“ (Khmer Rouge) a „Kambodža“ (Vietnamci) zavedly další úpravy vlajek před správou Organizace spojených národů, které letěly světle modrou vlajkou s siluetovou mapou země ve středu. Organizace spojených národů pomohla ukončit občanské konflikty a do roku 1993 vedla zemi ke svobodným volbám. 30. června téhož roku byla znovu vyzdvižena vlajka v letech 1948–70.
