Zvuk hromu v mnoha horách a údolích Bhútánu je tradičně považován za hlas draků a tato země je v rodném jazyce označována jako „Země hromu draka“. Nicméně, dračí design vlajky mohl být ovlivňován podobnými vzory používanými po staletí sousedními Číňany. Ve svých drápech drak na vlajce uchopí šperky, které zastupují národní bohatství a dokonalost. Drak, který byl původně zelený, je nyní bílý a symbolizuje čistotu a loajalitu různých etnických skupin v zemi. Žlutooranžová barva, kterou Bhútánská vláda oficiálně popisuje jako žlutou, je symbolem moci krále jako hlavy sekulární vlády, zatímco oranžovo-červená je spojena s Bka'-brgyud-pa (Kagyupa) a Buddhistické sekty Rnying-ma-pa (Nyingmapa) as náboženským závazkem národa.
Přesné datum zavedení této vlajky není známo, ale mohlo k tomu dojít v roce 1971, kdy se Bhútán připojil k OSN. Až do šedesátých lét byl Bhútán do značné míry uzavřen vnějšímu světu; jeho zahraniční vztahy byly vedeny přes Spojené království (1910–49) a Indií (od 1949 do 60. let). Bhutanova izolace a nedostatek mořského pobřeží přísně omezily okolnosti, za kterých byla vyžadována státní vlajka.
