Yahya Khan, v plné Agha Mohammad Yahya Khan, (narozen 4. února 1917, poblíž Peshawar, Indie [nyní v Pákistánu] - zemřel 10. srpna 1980, Rawalpindi, Pákistán), prezident Pákistánu (1969–71), profesionální voják který se v roce 1966 stal velitelem pákistánských ozbrojených sil.
Yahya se narodil rodině, která pocházela z elitní třídy vojáků Nādera Šáha, perského vládce, který dobyl Dillí v 18. století. Vystudoval Pandžábskou univerzitu a později absolvoval nejprve ve své třídě Indickou vojenskou akademii v Dehra Dun. Během druhé světové války sloužil v Itálii a na Středním východě a po rozdělení Indie v roce 1947 zorganizoval pákistánskou štábní kolej.
Poté, co sloužil ve válce s Indií nad oblastí Kašmíru, se stal nejmladším pákistánským brigádním generálem ve věku 34 let a jeho nejmladším generálem ve 40. letech. V roce 1966 se stal vrchním velitelem. Mohammad Ayub Khan, Yahya velel armádě, když v zemi vypukly pouliční nepokoje. Ayub ho vyzval, aby převzal vládu a zachoval celistvost Pákistánu. Byl jmenován hlavním správcem stanného práva, který prohlásil slovy „Nebudu tolerovat nepořádek. Ať se všichni vrátí na své místo. “
Yahya Khan následoval Ayub Khan jako prezident, když on rezignoval na jeho kancelář v březnu 1969. V roce 1971 došlo k vážnému konfliktu mezi ústřední vládou a Awami stranou toho, co bylo tehdy na východním Pákistánu, vedeným šejkem Mujiburem Rahmanem. Východní pákistánský vůdce požadoval autonomii pro svou polovinu geograficky rozdělené země a Yahya Khan odpověděl tím, že nařídil armádě potlačit Awami stranu. Brutalita, s jakou byly jeho rozkazy provedeny, a výsledný příliv miliónů východních pákistánských uprchlíků do Indie vedly k indické invazi do východního Pákistánu a k rutině okupantů ze západního Pákistánu. Východní Pákistán se stal nezávislou zemí Bangladéše a se ztrátou Yahya Khan rezignoval (20. prosince 1971).
Byl nahrazen ministrem zahraničí Zulfikarem Ali Bhuttem, který ho uvěznil. Krátce nato byl paralyzován mrtvicí a po jeho propuštění nehrál žádnou další důležitou politickou roli.
