Gelová chromatografie, také nazývaná gelová filtrace, v analytické chemii, technika pro oddělování chemických látek využíváním rozdílů v rychlosti, kterou procházejí ložem porézní polotuhé látky. Tento způsob je zvláště užitečný pro oddělení enzymů, proteinů, peptidů a aminokyselin od sebe navzájem a od látek s nízkou molekulovou hmotností. Separace složek směsi gelovou chromatografií je založena na rozdílech v molekulárních velikostech složek. Malé molekuly mají tendenci se difundovat do vnitřku porézních částic, takže jejich tok je omezen, zatímco velké molekuly nejsou schopny vstoupit do pórů a mají sklon k plynulému toku. Složky s nejvyšší molekulovou hmotností tedy opouštějí lože jako první a následně postupně menší molekuly. Nejrozšířenějšími materiály pro lože jsou polyakrylamid a polymer připravený z dextranu a epichlorhydrinu. Suché polymery jsou obvykle suspendovány ve vhodných činidlech za vzniku homogenní polotuhé směsi.
